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Depuis 1987, date à laquelle le peuple suisse a accepté l'initiative dite de Rothenthurm, les marais et les sites marécageux d'une beauté particulière qui présentent un intérêt national bénéficient d'une protection ancrée dans la Constitution fédérale.
Mais les marais ne sont pas sauvés pour autant. En effet, ils ont besoin d'une protection active, c'est-à-dire d'une exploitation et d'un entretien adéquats ou alors de mesures qui excluent toute exploitation
Cela entraîne des frais considérables pour la Confédération et les cantons. Le programme de suivi de la protection des marais devra montrer si les efforts entrepris ont porté des fruits. Le suivi repose principalement sur un relevé périodique de la végétation dans 100 marais sélectionnés au hasard. Un premier relevé a été effectué entre 1997 et 2001.
C'était la période où de nombreux cantons commençaient seulement à intégrer les buts de protection dans l'exploitation de leurs marais. Ainsi, ce premier relevé présente la situation initiale. Ce n'est qu'avec le second, qui sera achevé en 2006, que l'on pourra voir comment évoluent les biotopes marécageux.
Selon les premiers indices provenant de l'expérience pratique, les marais continuent de rétrécir et leur qualité décline. Ils subissent de nouvelles atteintes. Cette tendance à la dégradation semble néanmoins se ralentir depuis peu. De plus, certains marais déjà atteints ont pu être partiellement régénérés.
À l'issue du premier relevé, l ‘OFEFP souhaite présenter les biotopes des marais, précieux et menacés à la fois, dans une publication et faire le point, avec différents acteurs de la protection des marais, sur les efforts de protection entrepris.
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