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Parmi tous les milieux naturels de Suisse, ce sont les eaux qui ont le plus perdu de leur caractère naturel. La politique suisse en matière de protection des eaux vise en particulier à préserver ou à restaurer l’état naturel des rives lacustres et des cours d’eau, avec un espace et un débit suffisants et une bonne qualité d’eau.
Entrée en vigueur au 1er janvier 2011, la loi modifiée sur la protection des eaux (LEaux) prévoit un aménagement proche de l'état naturel des cours d'eau et des lacs. Elle définit notamment les mesures à mettre en œuvre et fixe les différentes responsabilités.
Principaux éléments de mesures:
Pour une efficacité optimale, ces mesures doivent être coordonnées. Ainsi, il ne sera guère utile de restaurer l'état naturel du lit d'un cours d'eau si le débit en aval de la centrale qui y est exploitée est quasi nul ou si des ouvrages artificiels empêchent les poissons d'accéder aux frayères. La qualité de l'eau doit par ailleurs être prise en compte dans les mesures d'aménagement.
Dans le cadre de la révision de la LEaux, la Confédération a défini des objectifs de développement pour les eaux suisses.
Pour préserver ou restaurer le caractère naturel des milieux aquatiques et des berges, les principales entraves doivent être supprimées. Des mesures s'avèrent donc nécessaires dans les domaines suivants:
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