Das BAFU betreibt und koordiniert mehrere Messnetze zum Thema Wasser. Mit Langzeitmessungen an fest installierten Messstationen und Einzelmessungen an temporären Standorten erhebt das BAFU den Wasserstand und die Wasserqualität der Schweizer Seen und Flüsse und des Grundwassers sowie die Wasserführung der Flüsse.