Groupe «qualité des eaux»
Ce groupe traite des aspects environnementaux du Doubs franco-suisse, tels que la qualité de l'eau, la protection des espèces, la morphologie du cours d'eau. Il s'appuie sur un groupe technique chargé du suivi de l'état de la qualité des eaux et des milieux aquatiques.
L'OFEV co-préside avec la préfecture du Doubs le groupe de travail binational pour l'amélioration de la qualité des eaux et des milieux aquatiques du Doubs. Y siègent également des représentants de l l'Office fédéral de l'agriculture et des cantons suisses concernés (Jura, Neuchâtel, Berne) ainsi que des autorités régionales et nationales françaises.
Début 2014, le groupe de travail «qualité des eaux» a adopté un plan d'action présentant les mesures à mener par les autorités compétentes pour réduire les impacts des activités humaines sur la qualité physico-chimique de l'eau et sur la morphologie du cours d'eau.