Les cours d’eau présentent une qualité biologique variable. Des déficits sont notamment observés sur le Plateau, région marquée par l’exploitation intensive, où les cours d’eau ont subi des modifications structurelles et où la migration des poissons n’est souvent pas garantie. La charge polluante provient essentiellement de l’agriculture pour les petits cours d’eau, des STEP pour les cours d’eau de taille moyenne.
Les données sur le macrozoobenthos collectées jusqu'ici sur des petits cours d'eau suisses ont été analysées sur mandat de l'OFEV (stations de mesure cantonales, monitoring de la biodiversité en Suisse). L'analyse montre que bon nombre de ces cours d'eau présentent une qualité biologique insuffisante : la moitié des 709 échantillons recueillis sur les 406 sites de prélèvement ne sont pas conformes aux exigences de l'ordonnance sur la protection des eaux.
Les plus grands déficits ont été enregistrés à basse altitude (entre 301 et 400 m), où plus de 70% des biocénoses d'invertébrés aquatiques témoignent d'un état écologique insuffisant, dû notamment à la pollution par les pesticides.
Une contamination par les pesticides a été décelée dans près de la moitié des échantillons. Elle est marquée dans les régions densément peuplées et les régions agricoles comme l'a révélé l'analyse de l'utilisation des sols dans le bassin versant des petits cours d'eau étudiés.
Des résultats différents selon la qualité des eaux superficielles
Les résultats des analyses biologiques réalisées dans le cadre de l'Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA, voir également ci-dessous) montrent un tableau contrasté. Près de 90 % des stations répondent aux objectifs de qualité pour l'indice des diatomées DI-CH, reflétant une charge en nutriments acceptable dans les cours d'eau.
L'évaluation du macrozoobenthos (indice IBCH) n'est pas aussi positive : dans les deux tiers des 88 stations évaluées, l'état du macrozoobenthos est bon, voire très bon. Un résultat comparable a été obtenu pour les macrophytes (état bon, voire très bon, pour env. 60 % des stations, hors cours d'eau avec peu de végétation). Pour ce qui est de la charge non polluante (morphologie, débit), la situation est meilleure pour les diatomées que pour les macrophytes.
Les analyses ichtyologiques réalisées au niveau de stations de mesure NAWA dans les zones à truite et les zones à ombre du Plateau montrent qu'à peine un tiers des tronçons échantillonnés présentent un état bon, voire très bon, deux tiers un état moyen et 10 % un état insuffisant. Cette situation s'explique notamment par des déficits dans la morphologie et la qualité des eaux, des débits trop faibles ou trop variables, ainsi que par la discontinuité des cours d'eau.
État des cours d’eau suisses

Résultats de l’Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) 2011–2014. 2016
Observation nationale et relevés
Tout comme les relevés physico-chimiques classiques, les analyses biologiques réalisées sur les plantes aquatiques, les diatomées, les macro-invertébrés et les poissons fournissent des informations sur l'état chimique, morphologique et hydrologique des cours d'eau. Ces données constituent d'excellents indicateurs pour l'appréciation de l'état des eaux. Les méthodes d'analyse de ces indicateurs, qui ont été élaborées sous la direction de l'OFEV et de l'Eawag dans le cadre du système modulaire gradué, sont utilisées dans les programmes de mesure cantonaux et nationaux.
Avec l'Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA), l'OFEV a créé en collaboration avec les cantons les bases de documentation et d'appréciation de l'état et de l'évolution des cours d'eau suisses au niveau national.
Coordination des analyses biologiques sur le haut Rhin
Des analyses biologiques coordonnées sont réalisées sur le haut Rhin depuis le début des années 1990 par les pays et les cantons riverains. Elles fournissent des renseignements utiles sur l'évolution à long terme de l'état biologique du fleuve. Elles montrent notamment que des espèces exotiques (néobiontes) sont arrivées dans le Rhin.
Analyses biologiques coordonnées du haut Rhin et de l’Aar de 2001 à 2013 (Résumé)

Rapport synthétique. 2016
Informations complémentaires
Evaluation des milieux crénaux de Suisse (PDF, 1 MB, 20.07.2016)Etude sur mandat de l'OFEV
Documents
NAWA : Documentation des stations (PDF, 112 MB, 15.05.2018)Chaix O., Stalder P., Hürlimann J. 2018: Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques, Documentation des stations (Startphase 2012–2013) sur mandat de l’OFEV
Poissons
NAWA TREND Biologie - 3e campagne (2019) (PDF, 1 MB, 30.11.2021)Sur mandat de l’OFEV
NAWA SPEZ Biologie - Relevés 2019 (PDF, 1 MB, 30.11.2021)Sur mandat de l’OFEV
NAWA - TREND Biologie - Streckendossiers Fische 2019 (PDF, 26 MB, 28.02.2022)Beschreibung der Befischungsstrecken im Auftrag des BAFU
NAWA TREND Biologie – Besatzkoordinationskarten Fische 2019 (PDF, 30 MB, 08.03.2022)Ninck L., Dönni W., Gouskov A., Guthruf J., Périat G., Vonlanthen P., Zaugg C. 2021: NAWA TREND Biologie, 3. Kampagne (2019), Karten Besatzkoordination Fische. Im Auftrag des BAFU.
NAWA: Rapport technique module poissons 2015 (PDF, 1 MB, 28.02.2017)Dönni W. et Guthruf J. 2017: Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques. Module Poissons. Sur mandat de l’OFEV.
NAWA : Rapport technique module poissons 2012-2013 (PDF, 5 MB, 09.10.2014)Dönni W. et Guthruf J. 2014: Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques. Module Poissons (phase de lancement 2012-2013). Sur mandat de l’Office fédéral de l’environnement OFEV
Quantitative Erhebungen Fische (PDF, 567 kB, 23.06.2014)Dönni W., Guthruf J., Riedl C., Werner S. und Zaugg C. 2014: Biologische Erhebungen der Nationalen Beobachtung Oberflächengewässerqualität (NAWA), Modul Fische: Quantitative Erhebungen (Startphase 2012–2013). Auswertungen im Auftrag des BAFU
Macrozoobenthos
NAWA TREND Biologie 2019 - lot macrozoobenthos Rapport technique (PDF, 8 MB, 30.06.2021)Sur mandat de l’OFEV
NAWA SPEZ Biologie - rapport sectoriel macrozoobenthos (Campagne 2018) (PDF, 2 MB, 26.10.2020)Sur mandat de l’OFEV
NAWA: Rapport technique module macrozoobenthos 2015 (PDF, 2 MB, 28.02.2017)Stucki P. et Knispel S. 2017 : Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques. Module macrozoobenthos 2015. Sur mandat de l’OFEV
NAWA: Rapport technique Macrozoobenthos 2011-2014 (PDF, 1 MB, 31.05.2015)Stucki P., Knispel S., Vicentini H. et Wagner A. 2015: NAWA TREND Biologie. Rapport Sectoriel Macrozoobenthos, campagne 2012, campagnes complémentaires 2011‐2014. Sur mandat de l’OFEV
NAWA: Äusserer Aspekt (PDF, 566 kB, 15.05.2018)Hürlimann J., Küng M., Straub F. 2014: NAWA TREND Biologie 2011-2013, Teil Äusserer Aspekt. Erfassung der Feldprotokolle und erste Analysen. Kurzbericht im Auftrag des Bundesamtes für Umwelt
Makrozoobenthos in kleinen Fliessgewässern – Schweizweite Auswertung (PDF, 2 MB, 05.06.2015)Externe Studie im Auftrag des BAFU
Diatomées
NAWA TREND Biologie 2019, Diatomées et Aspect général (PDF, 24 MB, 01.03.2021)Sur mandat de l’OFEV
NAWA SPEZ Biologie 2018 - Teil Diatomeen und Äusserer Aspekt (PDF, 1004 kB, 01.03.2021)Im Auftrag des BAFU
NAWA: Rapport technique module diatomées 2015 (PDF, 1 MB, 12.07.2017)Hürlimann J. und Straub F. 2017 : Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques. Module diatomées et aspect général 2015. Sur mandat de l’Office fédéral de l’environnement OFEV
NAWA-Fachbericht Modul Diatomeen 2011-2013 (PDF, 3 MB, 23.06.2014)2011-2013, Teil Diatomeen - Fachbericht - en allemand seulement
NAWA-Modul Makrozoobenthos/Diatomeen 2011-2013 Streckenfichen (PDF, 127 MB, 04.12.2014)Makrozoobenthos - Diatomeen - en allemand seulement
Macrophytes
NAWA-Trend Biologie - 3e campagne 2019 (PDF, 3 MB, 28.02.2021)Sur mandat de l’OFEV
NAWA : Rapport technique module Macrophytes 2015 (PDF, 1 MB, 30.06.2020)Roth E. et Müller N. 2017 : Observation nationale de la qualité des eaux de surface
(NAWA) – Relevés biologiques. Module macrophytes 2015. Sur mandat de l’Office fédéral de l’environnement OFEV
NAWA : Rapport technique module macrophytes 2015 : annexes a-e (PDF, 1 MB, 13.09.2019)Roth E. et Müller N. 2017 : Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques. Module macrophytes 2015 : annexe. Sur mandat de l’Office fédéral de l’environnement OFEV
NAWA : Rapport technique module macrophytes 2015 : annexe f (PDF, 208 MB, 13.09.2019)Roth E. et Müller N. 2017 : Observation nationale de la qualité des eaux de surface (NAWA) – Relevés biologiques. Module macrophytes 2015 : annexe. Sur mandat de l’Office fédéral de l’environnement OFEV
NAWA-Fachbericht Modul Makrophyten 2012 (PDF, 958 kB, 16.05.2014)Roth E. 2013: NAWA TREND Biologie Teilbereich Makrophyten 2012. Expertenbericht im Auftrag des BAFU - en allemand seulement
NAWA-Fachbericht Modul Makrophyten 2012 - Anhang f (PDF, 34 MB, 16.05.2014)Roth E. 2013: NAWA TREND Biologie
Teilbereich Makrophyten 2012: Messstellendossiers im Auftrag des BAFU - en allemand seulement
Evaluation des milieux crénaux de Suisse (PDF, 1 MB, 20.07.2016)Etude sur mandat de l'OFEV
Milieux crénaux
Dernière modification 01.12.2020